История развития экономического образования в Уфимском авиационном институте начиналась с изучения дисциплин экономического профиля студентами всех технических специальностей. Эту задачу выполняла кафедра экономики и организации производства, первым заведующим которой был Мирко П.Д., кандидат экономических наук, доцент, Заслуженный деятель науки и техники Республики Башкирия. В 1966 году в рамках существующей кафедры был осуществлен набор на специальность «Экономика и организация машиностроительного производства», что положило начало создания инженерно-экономического факультета. В январе 1972 года ректор УАИ Мавлютов Р.Р. подписал приказ о создании инженерно-экономического факультета, обеспечивающего подготовку специалистов в области экономики и организации производства предприятий в машиностроении. Этим же приказом деканом факультета был назначен кандидат экономических наук, доцент Смолдырев Д.А. Первый выпуск инженеров-экономистов в количестве 75 человек состоялся в 1971 году.

           В 80-ых годах проводятся структурные изменения факультета. Созданы новые кафедры – организации механизированной обработки экономической информации, научно-исследовательских и опытно-конструкторских работ, научной организации труда и заработной платы. В рамках научно-исследовательской лаборатории, возглавляемой профессором Гареевым В.М., совместно с предприятиями республики проводилось большое количество научно-исследовательских работ. Преподаватели факультета принимали активное участие в повышении экономического уровня руководящего состава предприятий. Второй этап структурных изменений приходится на конец 90-х, когда на факультете создаются кафедры экономики предпринимательства, финансов и экономического анализа, менеджмента и маркетинга, налогов и налогообложения, управления в социальных и экономических системах, чуть позже в состав факультета вошли кафедры экономической информатики, управления инновациями, социологии и социальных технологий, экономической теории.

           В 2006 году на базе факультета образован Институт экономики и управления, директором которого избирается доктор технических наук, профессор Исмагилова Л.А. – студентка первого выпуска экономистов. Институт сегодня – известный в Республике Башкортостан и за ее пределами центр экономического образования, инновационных образовательных программ и научных исследований, готовящий высококвалифицированных научно-педагогических работников и специалистов в области экономики, финансов, налогообложения, коммерции, менеджмента, маркетинга и прикладных информационных технологий. В институте обучается около 5000 студентов. С 1998 г. институт участвует в реализации Президентской программы подготовки управленческих кадров для организаций народного хозяйства РФ.

           В составе института 5 кафедр, каждая из которых возглавляется доктором наук, профессором. Уровень остепененности профессорско-преподавательского состава института свыше 60%. За годы существования подготовлено более 13 тысяч высокопрофессиональных специалистов, которые работают в различных должностях на промышленных предприятиях, в банковской системе, в налоговых органах, в управленческих структурах городов и регионов страны, в сфере науки и инфокоммуникаций, в образовательных учреждениях.